Registrace vlastního URL protokolu

 C# 
using Microsoft.Win32;

var appPath = "%SystemRoot%\SysWow64\notepad.exe";
var command = Registry.ClassesRoot.CreateSubKey(name);
command.SetValue("", appPath, RegistryValueKind.ExpandString); // výchozí hodnota


Předání parametru
"C:\Program Files (x86)\Skype\Phone\Skype.exe" "/uri:"%l""

Časté chyby:
Pozor na uvozovky v cestě k aplikaci. Obzvlášť pokud předáváte parametr.
Pokud chcete použít relativní cestu jako je %SystemRoot% nebo %windir% musíte ji uložit v hodnotě typu "Rozšiřitelná řetězcová hodnota"

Zdroj:
https://msdn.microsoft.com/cs-cz/library/aa767914(v=vs.85).aspx
https://msdn.microsoft.com/cs-cz/library/windows/desktop/ms724884%28v=vs.85%29.aspx?f=255&MSPPError=-2147217396
http://www.petefreitag.com/item/69.cfm